Neben Schul- und Tagesbetreuungsmöglichkeiten bietet St. Maria Fürstenzell mit dem Schülerwohnen auch stationäre Kinder- und Jugendhilfe an.
Die beiden Wohngruppen „Miriam“ und „Trevor“ in jüngst sanierten Räumlichkeiten bieten Platz für insgesamt 16 Kinder und Jugendliche im Alter zwischen 6 und 18 Jahren. Konzipiert als sozial- und heilpädagogische Wohngruppen, sind sie ein sicherer Schutzraum für junge Menschen aus schwierigen familiären Situationen oder mit Fluchterfahrungen.
Nach Schule und Tagesbetreuung in Hort oder offener Ganztagsschule kümmern sich pädagogische Fachkräfte und ein sozialpädagogischer Fachdienst um die Kinder und Jugendlichen, so dass eine lückenlose Betreuung aus einer Hand gewährleistet ist.